در مورد محل دفن حضرت فاطمه زهرا سلام الله علیها در کتابهای مختلف مطالب گوناگون نوشته اند؛ بعضی معتقدند که در جوار قبر پیامبر صلی اللَّه علیه و آله مدفون شده است و دلیلشان این حدیث شریف است که رسول خدا (ص) فرموده است:
«ان بین قبری، و منبری روضة من ریاض الجنة.»
همانا بین قبر و منبر من باغی از باغهای بهشت است.
این روایت گویا اشاره به محل دفن حضرت زهرا سلام اللَّه علیها است. مرحوم علامه مجلسی در بحار معتقد است که امیرالمؤمنین در نیمه شب جسد فاطمه را برداشت با دو فرزندش حسن و حسین و شش نفر از اصحاب به طرف قبر پیغمبر (ص) رفتند. بعضی هم معتقدند که در قبرستان بقیع به خاک سپرده شده است..
بعید نیست که آن امام مظلوم علیه السلام صورت چهل قبر را در بقیع ترتیب داده باشد تا کسی از قبر واقعی حضرت زهرا علیهاالسلام مطلع نشود و وصیت آن سیده مظلومه نیز عمل شود.